凝膠遷移貨電泳遷移率實驗（EMSA）是一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術，可用于定性和定量分析。目前這一技術還可以用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。其基本流程是將純化的蛋白和同位素生物素熒光素標記的DNA或RNA探針進行孵育，在非變性的聚丙烯凝膠電泳上，分離復合物和非結合的探針。

DNA復合物或RNA復合物比非結合的探針移動的慢。競爭試驗中采用含蛋白結合序列的DNA或RNA的片段和寡核苷酸片段（特異），和其他非相關片段（非特異），來確定DNA或RNA結合蛋白的特異性。還可以通過在體系中加入目的蛋白的特異性抗體，發生超遷移（super-shift），確定目的蛋白與基因片段的結合。在競爭的特異性和非特異性前段的存在下，依據復合物的特點和強度來確定特異結合。

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EMSA實驗    

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EMSA ( Electrophoretic Mobility Shift Assay ) 凝膠遷移實驗是一種研究DNA與蛋白質或RNA與蛋白質相互作用的常用技術。這項技術是基于DNA/蛋白質或RNA/蛋白質復合體在聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE）中有不同遷移率的原理。當核轉錄因子與一條人工合成的特異的DNA或RNA結合后，其在PAGE中的遷移率將小于未結合核蛋白轉錄因子的DNA，從而檢測到活化的與DNA或RNA結合的蛋白轉錄或調節因子。